实验报告

更新时间:2023-10-27 23:22:01 阅读量: 综合文库 文档下载

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实验报告

一.实验目的

质粒提取即将质粒与细菌基因组 DNA分开,去除蛋白质及其它杂质,以得到相对纯净的质粒。本次实验的目的主要是获得相对纯净的植物表达载体质粒E1-PUC18 二.实验内容

1.理解质粒提取的基本原理 2.熟悉质粒提取的基本操作步骤 3.获得相对纯净的目的质粒 三.实验原理

1.Buffer P1(重悬菌体,提供缓冲环境)

主要成分是50 mmol/L葡萄糖,25 mM/L Tris-HCl,10 mM/L EDTA,pH8.0 主要作用:悬浮菌体

葡萄糖增稠,使悬浮后的大肠杆菌不会快速沉积到离心管的底部;EDTA抑制DNase的活性,

2.Buffer P2(氢氧化钠和SDS裂解菌体细胞壁、在细胞膜上穿孔,释放细胞内的质粒)

主要成分是0.2mol/L的NaOH ,1% SDS

主要作用是破坏细胞壁和细胞膜,使细胞的内容物释放 其中NaOH主要是为了溶解细胞,释放DNA,因为在强碱性的

情况下,细胞膜发生了从双层膜结构向微囊结构的变化。SDS与NaOH联用,其目的是为了增强NaOH的强碱性,同时SDS作为阴离子表面活性剂破坏脂双层膜。

注意事项:第一,时间不能过长,因为在这样的碱性条件下基因组DNA片断也会慢慢断裂;第二,必须温柔混合,不然基因组DNA会断裂。破细胞的主要是碱,而不是SDS,所以称为碱法抽提。

3.Buffer P3(中和氢氧化钠、SDS中的钠被钾替换,吸附菌体产生沉淀)

主要成分是3mol/L的醋酸钾,2mol/L 醋酸,75%酒精 主要作用是沉淀蛋白和中和反应

其中醋酸钾是为了使钾离子置换SDS中的钠离子而形成了PDS,因为十二烷基硫酸钠(sodium dodecylsulfate,SDS)遇到钾离子后变成了十二烷基硫酸钾 (potassium dodecylsulfate, PDS),而PDS是不溶水的,同时一个SDS分子平均结合两个氨基酸,钾钠离子置换所产生的大量沉淀自然就将绝大部分蛋白质沉淀了。2 mol/L的醋酸是为了中和NaOH。基因组DNA一旦发生断裂,只要是50~100 kb大小的片断,就没有办法再被 PDS共沉淀了,所以碱处理的时间要短,而且不得激烈振荡,不然最后得到的质粒上总会有大量的基因组DNA混入,琼脂糖电泳可以观察到一条较亮的总DNA条带。75%酒精主要是为了清洗盐分和抑制

DNase;同时Buffer P3的强酸性也是为了使DNA更好地结合在硅酸纤维膜上 3.Buffer DW1

主要成分为去蛋白液,可以进一步降低蛋白残留量 4.Wash Solution 主要成分为80%的乙醇

主要是起到洗涤的作用,使质粒DNA纯化和沉淀 5.Elution Buffer

主要成分是pH=8.0的TE缓冲液

主要作用是最后把DNA从柱子上洗脱下来 四.实验器材

SanPrep柱式质粒DNA小量抽提试剂盒:生工生物工程(上海)股份有限公司

小型高速离心机,1.5ml离心管,无水乙醇等 五.实验步骤

菌体收集→裂解→上柱→洗涤→洗脱 1.准备工作

检查Buffer P1中是否已加入RNase A(储存于2-8℃,有效期为6个月)

检查Wash Solution中是否已经加入乙醇(乙醇终浓度为80%,室温密封保存)

检查Buffer P2和P3中是否出现沉淀(如有沉淀,于37℃溶解沉淀,待冷却至室温后使用)

2.取4ml过夜培养(37℃摇床振荡培养14h)的E1-PUC18菌液(分装于4个1.5ml的EP管中)12000×g离心10分钟收集菌体,弃尽培养基

3.在沉淀中加入250μl Buffer P1,彻底悬浮菌体

4.加入250μl Buffer P2,立即温和颠倒离心管10次(两手来回颠倒),然后室温静置4分钟(开盖后有拉丝的现象,说明效果较好)

5.加入350μl Buffer P3,立即温和颠倒离心管5次混匀(将离心

管在试管架上翻转过来左右摇晃5次)

6.12000×g离心10分钟,将上清液移入吸附柱(只能装750μl,应多次离心),9000×g离心30秒,倒掉收集管中液体 7.(选做)加入500μl Buffer DW1,9000×g离心30秒,倒掉收集管中液体

8.加入500μl Wash Solution,9000×g离心30秒,倒掉收集管中液体

9.重复步骤8一次

10.空吸附柱于9000×g离心1分钟

11.将吸附柱放入一个干净的1.5ml离心管中,在吸附膜中央加入

65μl Elution Buffer(60℃预热),室温静置一分钟后,离心1分钟,保存管中DNA溶液(-20℃) 六.结果分析与讨论

琼脂糖凝胶电泳结果显示质粒浓度偏小,未有明显条带。原因可能有

1.菌液浓度太低

2.质粒提取操作某些细节可能存在问题

本文来源:https://www.bwwdw.com/article/9mq2.html

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