大肠杆菌表达重组蛋白的超声破碎及纯化
更新时间:2023-10-18 16:55:01 阅读量: 综合文库 文档下载
大肠杆菌表达重组蛋白的超声破碎及纯化
一 可溶性蛋白的纯化
(一)菌体的破碎 1. 仪器与材料:-80℃冰箱;超声波细胞破碎仪;50mM PBS或50mM Tris-HCl pH 7.5;50ml 离心管;冷冻高速离心机
2. 方法
2.1反复冻融
2.1.1收集菌液500ml,等分10份,4000 r/min 4℃离心15min,弃上清。
2.1.2 菌体沉淀中加入相同菌液体积的50mM PBS 或50mM Tris-HCl(选择使蛋白稳定的缓冲液和pH)重悬洗涤一次。
2.1.3 然后按原菌液体积的1/4加入缓冲液重悬菌体,并加入蛋白酶抑制剂PMSF和EDTA(带His标签不加),PMSF终浓度为100μg/ml, EDTA的终浓度为 。取20μl重悬菌液进行电泳,检测蛋白表达的情况(是否表达,是可溶性表达还是包涵体表达)。
2.1.4 将菌液(经检测有表达)在-80度冰冻,室温融解,反复几次(反复冻融三次),由于细胞内冰粒形成和剩余细胞液的盐浓度增高引起溶胀,使细胞结构破碎。
2.2 超声波处理 (对超声波及热敏感的蛋白慎用)
2.2.1 将反复冻融的菌液(必要时可加入1mg/ml 溶菌酶,缓冲液pH>8.0,加入后需静置20min),进行超声破碎,超声条件:400W,工作5秒,间隔5秒,重复一定次数,(根据我们的仪器找出一个比较好的工作条件)。直至菌体溶液变清澈为止,大约花费时间 。
2.2.2 取少量经超声破碎后的菌液,10000rpm离心10分钟,分别对上清和沉淀进行检测,并用全菌作为阳性对照,检测菌体破碎程度及目标条带占总蛋白的含量。
注意事项:
(1) 超声破碎具体条件可根据实验情况而定,要掌握好功率和每次超声时间,降低蛋白被降解的可能。
(2) 功率大时,每次超声时间可缩短,不能让温度升高,应保持在4度左右,超声时保持冰浴。
(3)菌体破碎后总蛋白浓度的测定可用Bradford 法或者紫外吸收法。
(4)可通过SDS-PAGE 电泳观察菌体破碎程度及目标条带占总蛋白的含量。
二 包涵体蛋白的纯化
1 菌体的破碎 (加溶菌酶处理包涵体效果可能不好,包涵体中总是有残留的溶菌酶,你看看有没有不加溶菌酶的,这个先保留好了)
1.1仪器与材料:超声波细胞破碎仪;20mM PBS或20mM Tris-HCl pH 7.5;裂解液buffer A;溶菌酶10mg/ml;50ml ,15ml离心管;冷冻离心机 1.2 方法
(1) 收集菌液500ml,等分10份,4000 r/min 4℃离心15min,弃上清。
(2)菌体沉淀中加入相同菌液体积的20mM PBS 或20mM Tris-HCl(选择使蛋白稳定的缓冲液和pH,一般为7.5-8.0),重悬洗涤2-3次,弃掉上清。 (3)然后沉淀按原菌液体积每500ml以15ml预冷的裂解液bufferA重悬。(有的文献为每克湿菌加4ml -10ml裂解液)
(4)每毫升悬液中加入100ul 10mg/ml溶菌酶(即溶菌酶终浓度1mg/ml)。在冰上孵育15min
(5)对15ml悬液进行超声破碎,超声条件:400W,工作5秒,间隔5秒,重复一定次数。超声破碎时保持冰浴。具体条件可根据实验情况而定。 (6) 4℃,4000 rpm/min离心20分钟所得沉淀即为包涵体。
注意事项:融合蛋白的分子量如果大于150KD时,用超声波破碎很容易将目标蛋白打碎而造成降解,故可用溶菌酶先做处理.
2 包涵体的洗涤
(1) 将包涵体沉淀重悬于含有适量脲(1-4M)的Buffer A中,每克湿重加4-6ml洗涤液。
(2) 超声波处理5秒打碎沉淀,继续用注射器吸入并挤出悬液,重复数次,4℃涡旋悬液30min。或者高速搅拌悬液10min。 (3) 4℃,4000 rpm/min离心15分钟。
(4) 重复上述操作2次至上清液透明无色。 (5) 将包涵体沉淀重悬于Buffer A,4℃,4000 rpm/min离心15分钟,弃掉上清。
注意事项:
(1) 包涵体洗涤时增加NaCl浓度到0.5M,有助于包涵体中杂蛋白的溶解。 (2) 经提取洗涤后得到的包涵体,由还原SDS-PAGE电泳结合光密度扫描可知包涵体中目标蛋白的含量。
(3) 包涵体洗涤是纯化极重要的一步,不同培养条件下收集的菌液经洗涤可得到不同的纯度。 50mM Tris-HCl pH 8, 0.2mM EDTA, 100mM NaCl, 1% Triton x-100 (或2% 脱氧胆酸钠) 1mM DTT 1mM PMSF 10mg/ml大肠杆菌表达重组蛋白的超声破碎及纯化
(4) 用通常的洗涤方法,如果包涵体达不到所需的纯度,可试用分级沉淀法初纯包涵体,步骤如下:
(1) 菌体破碎后将所得的包涵体悬浮于含6mol/L盐酸胍的Buffer A中,4℃涡旋悬液30min ,4000r/min离心20min,上清进行分级沉淀。 (2) 取一小部分上清用Buffer A稀释到盐酸胍浓度为4 M,然后4℃涡旋悬液15min,静置30min,4000r/min离心20min,上清继续稀释到3M,重复上面操作一直到2M,把每次沉淀和上清跑SDS-PAGE电泳分析,看目标蛋白在哪个盐酸胍浓度下纯度最高。
(3) 摸索好条件后,直接将剩余上清直接用Buffer A稀释到所需的盐酸胍浓度,然后4℃涡旋悬液15min,静置30min,4000r/min离心20min,沉淀既为分级沉淀后的包涵体。 超声破碎
在建立表达条件过程中,小量制备样品可用小型超声细胞粉碎仪。离心1.0~1.5ml 诱导后的菌液收集菌体,然后视菌体的量加入300~500μl的缓冲液重悬细胞,然后置于冰上超声破碎。因很多实验室有自己的小型超声粉碎器,各个操
作不尽相同,具体操作参考仪器说明书。常规操作步骤如下(以100ml 培养液为例):
(1)100 ml 诱导后的菌液(OD600=1.2 左右),12000 rpm,4℃离心2min,收集菌体。 (2)加入预冷的缓冲液50ml,重悬细胞洗涤菌体一次,12000 rpm,4℃离心2min,收集菌体;常规的操作所使用的缓冲液多为PBS 或者 Tris-NaCl,针对不同的载体和纯化方法,选择相应的缓冲液。对于一些蛋白酶敏感的目的蛋白,可以在整个操作过程中加入一些蛋白酶抑制剂。
(3)向沉淀中加入15ml的缓冲液同上(若菌体太浓,可加倍),充分悬浮,将菌悬液装在一个玻璃小烧杯中,置于冰水混合物中。
(4)破碎:将用缓冲液洗涤过的超声探头伸入到菌液中,不要接触烧杯底部,每处理30sec间隔1min使菌液冷却,输出强度为5~6,频率为60~70%。 (5)分离上清和沉淀:12000 rpm,4℃离心20min,分离上清和沉淀。 (6)SDS-PAGE 分析蛋白表达情况。 (7)准备纯化蛋白。
超声破碎注意事项与一些小的改进:
(1)破碎完全的判断:超声前菌悬液是浑浊的,超声完全后变的透明、清澈。 (2)如果超声时出现黑色沉淀,说明超声功率太强。(3)超声时间太长、功率太高对蛋白活性肯定有影响。(4)尽量防止泡沫的产生。(5)大量破碎时将菌液置于一玻璃器皿中,破碎时放在冰水混合物中,以增加散热,减小对蛋白的破坏作用。 (6)破碎前的预处理,在破碎前可用溶菌酶(100μg/ml)处理破环细胞壁(10min,30℃),增加细胞的通透性。
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