西北农林科技大学 生物技术综合大实验
更新时间:2024-05-04 03:17:01 阅读量: 综合文库 文档下载
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生物技术综合大实验——原核系统表达的
绿色荧光蛋白的纯化
宋捷(2012014069) 纪成功 孔令浩 王玉康 王鹏程 董奉新
(西北农林科技大学)
摘要:绿色荧光蛋白(GFP)的提纯是一套十分成熟的蛋白质提纯系统,本教学实验使用原核的大肠杆菌系统,通过转化带有GFP基因的原核表达载体到BL21表达菌株中,通过氨苄抗性筛选,用阿拉伯糖诱导表达。通过硫酸铵盐析,疏水层析,阴离子交换柱层析,凝胶过滤层析,各级纯化用紫外显色和SDS凝胶电泳检测,终末纯化后纯度较高。本实验较为成功的提取提纯了GFP,并较好训练蛋白质提纯技术。
关键词:GFP 蛋白提纯 疏水层析 离子交换层析 凝胶过滤层析
1. 介绍:GFP最早是由下村修等人在1962年在一种学名Aequorea victoria的水母中发
现。其基因所产生的蛋白质,在蓝色波长范围的光线激发下,会发出绿色萤光。分子质量约为27kd,有238各氨基酸基团],三维结构为β 圆柱,圆柱两端由一些较短的α 螺旋盖住,圆柱中央是几段α 螺旋,生色团位于圆柱中央。该结构性质稳定。本实验通过该分子的较为稳定,疏水特性,易电离成阳离子,分子较小的体征,选择盐析,疏水层析,阴离子交换层析,凝胶过滤层析逐级提纯GFP。 2. 材料和方法
2.1. pGFP质粒克隆及提取
质粒是已经构建完成的,GFP基因表达由易受阿拉伯糖诱导的启动子控制,及常表达的氨苄抗性。碱裂解法(试剂实验室自配)提取。取1ml菌液于1.5ml离心管,1000rpm离心30s,弃上清——加入100μl提质粒溶液I,震荡混匀——加入200μl溶液II,温和混匀置至于冰上5min——加入150μl溶液III,混匀,置于冰上5min——1000rpm离心3min,转移上清于另一新1.5ml离心管,加入900μl无水乙醇,混匀,室温静置3min——12000rpm离心5min,弃上清,待其干燥——于30μl TE中溶解,冰上暂存。 2.2. 转化
取1.5ml OD600 0.3~0.4 BL21,冰浴30min——4000rpm离心10min,弃上清——加入200μl 0.1M CaCl2——悬浮沉淀,冰浴15min——4000rpm离心10min,弃上清——加入200μl 0.1M CaCl2悬浮沉淀,备用。取1μl质粒DNA加入制备好的感受态细胞,温和混匀,置于冰上30min——42°C水浴锅,热击45-60s——冰浴10min——加入900μl LB培养基,37°C,150rpm震荡培养30min——涂板(LBp/ara),37°C温育过夜。
2.3. 筛选重组子及扩大培养
将平板放置紫外灯下检测,标记,挑取绿色荧光单菌落,于5mlLB(amp)培养基中37°C、150rpm震荡培养7小时——吸取2ml菌液,置于200mlLB(amp/ara)培养基中,37°C、150rpm振荡培养过夜。本组的平板并无可视菌落,所以挑去他组菌落 2.4. 收菌破碎
收集菌液200ml于250ml离心管,共4管,5000xg离心10min,弃上清——每管30ml溶解缓冲液(50mM Tris-HCl,1mmol/L EDTA)重悬沉淀,将4管合并为1管——每管加入60μl溶菌酶,混匀
将离心管置于冰上,超声波破碎仪探头插入离心管,探头离底部约1cm且不触离心管壁——900w,超声3s,静止3s,共8min,重复3次——7500xg离心15min,在紫外灯下观察沉淀(留样)和上清(留样),取上清备用。 2.5. 盐析
取上清定容至80ml——取10ml做预实验——用溶解缓冲液稀释至100ml——分装至10只试管,每管10ml——称取不同浓度梯度(NH4)2SO4(见下表),室温静置15min——各取1ml于1.5ml离心管,7500rpm离心15min——在紫外灯下观察GFP沉淀情况,可看出,第五管((NH4)2SO4含量50%)时出现沉淀(杂蛋白),第八管((NH4)2SO4含量80%)沉淀量最大(GFP)——在剩余70ml上清中加入20.37g(NH4)2SO4(含量50%),室温静置30min——7500rpm离心15min,取上清——加入36.12 g(NH4)2SO4(含量80%),室温静置15min——7500rpm离心15min,弃上清,-20°C保存。 (NH4)2SO10% 20% 30% 40% 50% 60% 70% 80% 90% 100% 4(%) (NH4)2SO0.70 1.06 1.64 2.26 2.91 3.61 4.36 5.16 6.03 7.06 4(g)
2.6. 疏水层析
配制 平衡缓冲液:2mol/ml(NH4)2SO4/TE,PH8.0 start buffer A:1.3mol/ml(NH4)2SO4/TE,PH8.0 洗脱缓冲液B:10mM Tris,1mM EDTA,PH8.0
将沉淀好的GFP用10ml 平衡缓冲液溶解,9000rpm离心10min,移上清液至另一大离心管备用。 连接仪器,蒸馏水洗柱,确保仪器运行正常——填装柱材(Phenyl Sephadex CL 4B),用3倍体积(约120ml)的平衡缓冲液平衡柱子(转速29转/分)——将含GFP的上清液上柱,3倍体积(约120ml)洗脱缓冲液洗脱(转速60转/分)——紫外灯观察GFP运动情况,结合层析图谱,当GFP快要流出时,收集——收集下来的液体留样,剩下部分装入处理好的透析袋中,用离子交换层析的start buffer A(20mM Tris-HCl,pH7.0)透析过夜。
2.7. 阴离子柱层析
配制 start buffer A:20mM Tris-HCl,pH7.0
洗脱缓冲液B:20mM Tris-HCl,pH7.0(含1M NaCl)
将疏水作用层析的透析袋用PEG10000浓缩——start buffer A洗柱——填装柱材(DEAE Sephadex A 50),用3倍体积(约120ml)的start buffer A平衡柱子(转速
30转/分)——将含GFP的浓缩液上柱,3倍体积(约120ml)start buffer A及洗脱缓冲液B梯度洗脱(转速60转/分)——紫外灯观察GFP运动情况,结合层析图谱,当GFP快要流出时,收集——收集下来的液体留样,剩下部分装入处理好的透析袋中,用凝胶过滤层析的缓冲液(20mM Tris-HCl,pH7.0)透析过夜。 2.8. 凝胶过滤层析
配制缓冲液:20mM Tris-HCl,pH7.0
将离子交换层析的透析袋用PEG10000浓缩——缓冲液洗柱——填装柱材(Sephadex G-75),用3倍体积(约120ml)的缓冲平衡柱子——将含GFP的浓缩液上柱,缓冲液洗脱——紫外灯观察GFP运动情况,结合层析图谱,当GFP快要流出时,收集——收集下来的液体留样,剩下部分装入处理好的透析袋中,用PEG10000浓缩——浓缩好的液体收集备用。 2.9. SDS凝胶电泳检测 3. 实验结果
GFP用硫酸盐最佳沉淀点的选择
收集硫酸铵浓度在50%~80%的蛋白质沉淀。 3.1. 3级层析图谱
疏水层析图谱
收集紫外荧光显色较亮的四管,对照图中区域大约如箭头所示(陡升由于调高了敏感度)
离子交换柱层析
收集紫外荧光显色较亮的3管,对照图中区域大约如箭头所示
凝胶过滤层析
图中所显示区域未收集,在所示时间外有一管带微弱荧光,收集。
3.2. SDS-page电泳图
3.3.
自左向右箭头所指条带依次是1他组三级纯化产物 2 本组三级纯化微弱荧光样品 3 离子交换纯化产物, 4离子交换层析传出+wash ,5 Maker ,6 疏水层析产物浓缩产物, 7 疏水层析产物 ,8 疏水层析wash, 9 细胞破碎后上清 ,10 细胞破碎液体(可靠性较高的1,2,3,9,10标示泳道,蓝色箭头位置推测为目标条带) 4. 分析与讨论
4.1. 本组的重组子平板次日早晨检查时并没有可视菌落出现,继续培养,到下午是可看到
2到3个绿色的重组子群落,分析可能是1.转化后菌株过于脆弱 2.可能氨苄涂抹过多 3.涂布器使用时未控制好温度 4.2. 在用硫酸盐沉淀的时候,,我总是主张直接用最大浓度硫酸盐直接沉淀,应该是有问
题的,GFP有明显的荧光信号,很容易在盐析粗提的时候去除溶解性相差较大的杂蛋白。
4.3. 细胞破碎后收集的液体有十分明亮的荧光,GFP的疏水性较强,可与柱材上疏水基团
结合,在盐离子浓度降低时解离,疏水层析结果如图,推测前几个峰出现时洗掉了数个杂带,可惜SDS电泳时失误,并不能看出哪些条带被洗掉。在装自装柱时,由于我并不熟练,导致柱子上盖胶条不紧,以及忘记初始化自动收集装置(阀门就没开),使得在平衡柱子的时候不停漏液,耽误了进度,也浪费了柱子 4.4. 离子交换柱有十分好的纯化效果,目的蛋白区域有极高的吸收峰,局部浓度可能过高,
下次要减缓流速,因为无法测量当时离子浓度,并不能给蛋白解离离子浓度区域给出建议,从电泳图上看,第三道,目标蛋白十分清晰,在上方存在数个杂蛋白(5个?) 4.5. 凝胶过滤层析时,出现了数个失误 1 改变柱子压力位置 ,2 转速过大(压力过大),
3柱子填充过多,吸出一部分重装填,导致凝胶分层(后期大量蛋白卡在分界面) 4 与组员没有商讨好实验方案,导致中途实验进程不顺利 ,5 出现下方爆管,凝胶及蛋
白漏出,重装填后不能洗出。
电泳图上出现大量抖峰,是管内出现气泡所致,原因可能如下1 从下方给予负压,且流速过大 2 下方的管口漏气(一侧缝隙我们添加了液体,并未漏泄,接口处可能漏液),3 凝胶的缝隙中本身有空气,4,buffer并未排气,在负压条件下溶解的空气被析出 4 压强过低出现真空泡
由于出现了大量蛋白卡在分界面上,且前期从电泳图上看到分离出约两种杂蛋白,我们采取了倒出胶体重新装柱,重新洗脱的方法,所以紫外吸收图谱并未记录。
4.6. 凝胶电泳的分离胶是我配的,一块水封时候用力过大,出现了凹面,并未有多余,所
以只好自用,对点样结果的的美观性有影响,组员点样的时候可能出现失误,使得5,6,7,8与位置不符合,可能未点上。从前三个泳道分析,小韦组结果十分好,目标条带及其明亮,可能我们组拿的并不是波峰管,所以上方有微弱杂带。我们的离子交换柱结果较好,凝胶柱图谱上显示两个杂蛋白,在电泳图上的确比离子柱少两个杂带,图上红色所示,层析依旧是有作用的。泳道4,推测是离子交换柱的穿出和wash液,目标条带区域有浅色痕迹,可能是蛋白与柱体结合不紧密,依旧有少量渗漏。 5. 参考文献
陈鹏 生物技术综合大实验 西北农林科技大学生物技术大实验 邓超等 绿色荧光蛋白及其应用 中国生物工程杂志
赵仲麟等 内含肽介导的绿色荧光蛋白纯化 河南农业大学学报
参考文献
白漏出,重装填后不能洗出。
电泳图上出现大量抖峰,是管内出现气泡所致,原因可能如下1 从下方给予负压,且流速过大 2 下方的管口漏气(一侧缝隙我们添加了液体,并未漏泄,接口处可能漏液),3 凝胶的缝隙中本身有空气,4,buffer并未排气,在负压条件下溶解的空气被析出 4 压强过低出现真空泡
由于出现了大量蛋白卡在分界面上,且前期从电泳图上看到分离出约两种杂蛋白,我们采取了倒出胶体重新装柱,重新洗脱的方法,所以紫外吸收图谱并未记录。
4.6. 凝胶电泳的分离胶是我配的,一块水封时候用力过大,出现了凹面,并未有多余,所
以只好自用,对点样结果的的美观性有影响,组员点样的时候可能出现失误,使得5,6,7,8与位置不符合,可能未点上。从前三个泳道分析,小韦组结果十分好,目标条带及其明亮,可能我们组拿的并不是波峰管,所以上方有微弱杂带。我们的离子交换柱结果较好,凝胶柱图谱上显示两个杂蛋白,在电泳图上的确比离子柱少两个杂带,图上红色所示,层析依旧是有作用的。泳道4,推测是离子交换柱的穿出和wash液,目标条带区域有浅色痕迹,可能是蛋白与柱体结合不紧密,依旧有少量渗漏。 5. 参考文献
陈鹏 生物技术综合大实验 西北农林科技大学生物技术大实验 邓超等 绿色荧光蛋白及其应用 中国生物工程杂志
赵仲麟等 内含肽介导的绿色荧光蛋白纯化 河南农业大学学报
参考文献
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