ADF 和Materials Studio等软件及与编程有关的问题

ADF 和Materials Studio等软件的相关问题

郭 勇

新疆大学化学化工学院物化专业硕三

精忠报国的忠烈－岳飞

岳飞，字鹏举。公元1103年出生于河南汤阴县永和乡孝悌里岳家庄。20岁投军，一生征战，屡建功勋，但在政治上却多有挫折。对此，他胜而若否，挫则愈奋，终于由一名普通的士兵成长为支撑南宋半壁江山的著名将帅。宋高宗绍兴十一年，1142年，被奸臣，昏君杀害，年仅39岁。宋孝宗时始昭雪，谥号武穆。

他背上的精忠报国四个大字，深入肤理。是他一生信念的真实写照。其精忠报国之心主要表现在对恢复中原这一战略目标始终不渝的坚持上。

在金朝进攻面前，以宋高宗赵构和奸相秦桧为首的投降派，不惜向金朝屈膝称臣，阻挠和破坏抗金斗争。为了实现恢复中原的战略目标不，岳飞不得不既要与金兵在战场上拼杀，又要同自己营垒中的投降派进行斗争。对他来说，后者比前者困难更大。

在朱仙镇大胜后，他曾对部下说，真抵黄龙府，与诸君痛饮耳。正准备渡河北上时，宋高宗却令其班师，一日12道金牌，岳飞怆然泪下：十年之功，废于一但。不难看出，岳飞主张抗战到底，坚决反对投降议和。正因如此，他才累犯天威，为他后来惨遭杀害埋下了祸根。 岳飞把精忠报国四字刺之于背，铭记于心，为之奋斗，始成功于此，终得罪于此，这是当时特定历史条件下出现的悲剧，\君王无远略，大将亦何能\。也正因如此，才越发显示出岳飞爱国之心的可贵。错综复杂尖锐的斗争锻炼了岳飞对国家的忠烈，从而造就了忠烈的岳飞。

赵构统治集团对岳飞采取的是极端自私的利用和猜防并且的手法，在岳飞成为他们推行投降路线的最大障碍时，他们就露出了本来面目。绍兴十一年四月，罢岳飞兵权，积极罗织罪名，诬陷岳飞造反。于十二月二十九日，以莫须有罪名，将岳飞及子岳云，战将张宪等人处死。功业未竟，反遭此果，天下冤之。

岳飞之所以成为名彪千古的著名将帅，最根本的原因是强烈的爱国心对他的激励，他因此忘我奋斗，不屈不挠，壮怀激烈。这是他成功的内在原因。外族入侵，宋庭腐败的时势给了他施展自己才能的条件，同时又制约了他的发展，使他成为一名以忠烈为主要特征的悲剧式英雄。也正因为如此，人们才对他更加敬仰。可谓忠烈精神充天地，故使英名永不朽。

满江红

——岳 飞

怒发冲冠，凭栏处潇潇雨歇。 抬望眼，仰天长啸，壮怀激烈。 三十功名尘与土， 八千里路云和月。

莫等闲白了少年头，空悲切。

靖康耻，犹未雪； 臣子恨，何时灭！ 驾长车踏破贺兰山缺。 壮志饥餐胡虏肉， 笑谈渴饮匈奴血。

待从头收拾旧山河，朝天阙。

ADF 和Materials Studio等软件的相关问题

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20用molden建模时有那些技巧和注意事项 1 一个Materials Studio中建立复杂化合物的问题。 发信人: vandal (), 信区: Gaussian

标 题: 一个Materials Studio中建立复杂化合物的问题。 发信站: BBS 大话西游站 (Thu Sep 23 14:54:05 2004), 转信

如下面的这种原子参数怎样在Materials Studio中建立一个晶体呀？ 该化合物本来是ABC3形式的，只是部分C被D替代了。 化合物结构简式：ABC2D SG=Pm3m

Atom Position x y z A 1 (a) 0 0 0 B 1 (b) 1/2 1/2 1/2 (C,D) 3 (c) 0 1/2 1/2

还有如这种：SG=I41/a

Atom Position x y z Occupancy Biso(A2) A 4a 0 0.25 0.125 4 0.66 B 4b 0 0.25 0.625 4 1.14 C 16f -0.1543 0.4951 0.7083 11.98 1.57 D 16f -0.1543 0.4951 0.7083 4.02 1.57

这样一个晶胞怎么建立亚？

还有这里的position是什么意思呀，这上下两个还不一样？

麻烦说的越详细越好，我很多都不懂，刚刚接触，请赐教！！ 还有可以看什么书来弥补这方面的不足亚？

Re: 一个Materials Studio中建立复杂化合物的问题。 发信人: neweroica (新英雄), 信区: Gaussian

标 题: Re: 一个Materials Studio中建立复杂化合物的问题。 发信站: BBS 大话西游站 (Thu Sep 23 21:23:19 2004), 转信 对于ABC3形式的，SG=Pm3m表示的是第221号空间群。

针对于你的这种化合物的晶体，类似的例子有：BaTiO3, PbTiO3, PbZrO3 等。 原胞基矢量是： A1 = a X A2 = a Y A3 = a Z

Position就是指A,B,C三种原子的位置，当然，是用分数坐标表示的。写全了就是： B1 = 0 (A) (1a)

B2 = ½ A1 + ½ A2 + ½ A3 = ½ a X + ½ a Y + ½ a Z (B) (1b) B3 = ½ A2 + ½ A3 = ½ a Y + ½ a Z (C) (3c) B4 = ½ A1 + ½ A3 = ½ a X + ½ a Z (C) (3c) B4 = ½ A1 + ½ A2 = ½ a X + ½ a Y (C) (3c)

不过，符号1a,2b,3c，还有你说的第二种空间群里的16f中的a,b,c,f这些符号是怎么规定的，我倒是不太清楚，有谁知道还请告知一声。 附带：

上述坐标关系可以用我编写的Cartes软件通过对称操作构造出晶胞来，具体你可以参见Cartes软件使用说明。 参考网址：

http://cst-www.nrl.navy.mil/lattice/struk/e2_1.html

Re: 一个Materials Studio中建立复杂化合物的问题。 发信人: neweroica (新英雄), 信区: Gaussian

标 题: Re: 一个Materials Studio中建立复杂化合物的问题。 发信站: BBS 大话西游站 (Thu Sep 23 23:00:41 2004), 转信 找了一个晚上，终于找到了”1a 2b 3c 16f...“的含义： 这实际上是Wyckoff位置（Wyckoff Positions）的标记

Re: 一个Materials Studio中建立复杂化合物的问题。 发信人: vandal (), 信区: Gaussian

标 题: Re: 一个Materials Studio中建立复杂化合物的问题。 发信站: BBS 大话西游站 (Fri Sep 24 16:06:54 2004), 转信

兄弟，我现在想知道的是在Materials Studio中怎样把这些原子添加进去，怎样添加？ 特别是这个，

(C,D) 3 (c) 0 1/2 1/2

表示c.d在同一个位置？但是这样的话，在materials studio中添加不进去呀？

还有这个

C 16f -0.1543 0.4951 0.7083 11.98 1.57 D 16f -0.1543 0.4951 0.7083 4.02 1.57

c.d完全在一个位置？只是那个occupancy不同？但是materials studio中这个值是0-1亚

还有有些又把这个关系写成 C/D(1) 4a 0 0 0.25 C/D(2) 8h 0.7745 0.2745 0 跪求大家帮忙亚，呜呜，快崩溃了。

Re: 一个Materials Studio中建立复杂化合物的问题。 发信人: neweroica (新英雄), 信区: Gaussian

标 题: Re: 一个Materials Studio中建立复杂化合物的问题。 发信站: BBS 大话西游站 (Fri Sep 24 19:50:23 2004), 转信

老兄，你还是没理解Wyckoff Positions的含义，建议你仔细看看我关于Wyckoff Positions的那个帖子，并且仔细去我推荐那两个网址上看一下。

C和D当然是两个不同的原子了，为什么非要写在一起？因为它们的Wychoff Positions相同，都是3(c)这个Position，这里的3表示这个位置可以总共转出3个等价的原子，c是Wyckoff字母，没有实际物理意义，只是一种区分的符号罢了。”0 1/2 1/2“是这个位置的分数坐标，显然它不属于”一般位置“，而是”特殊位置“。总之， (C,D) 原子是处于这样的一种位置，第一个位置是处在分数坐标为（ 0 ，1/2， 1/2 ）的点上的；第二和第三个位置则是要通过这个晶体的对称元素来转出来的。怎么转呢？查一下Wyckoff Positions表（见

http://www.cryst.ehu.es/cryst/get_wp.html ）可得3c位置的对称元素是4/mm.m，各点的坐标如下：

(0, 1/2 , 1/2 ) (1/2 , 0, 1/2 ) (1/2 , 1/2 , 0)

这三个位置，就是你所说的(C,D)占的位置，其中一个是C，另两个放D。

Re: 一个Materials Studio中建立复杂化合物的问题。 发信人: vandal (), 信区: Gaussian

标 题: Re: 一个Materials Studio中建立复杂化合物的问题。 发信站: BBS 大话西游站 (Tue Sep 28 09:06:08 2004), 转信

但是在Materials Studio中，它是根据对称性来弄得呀，就是说它自己会根据对称性添加上原子？还有就是到底哪个原子占据那个位置是不是要通过试试计算看那个的能量最低来确定？

Re: 一个Materials Studio中建立复杂化合物的问题。 发信人: neweroica (新英雄), 信区: Gaussian

标 题: Re: 一个Materials Studio中建立复杂化合物的问题。 发信站: BBS 大话西游站 (Tue Sep 28 14:44:37 2004), 转信 呵呵，对，他的化合物是AC2D。我没看清楚。

2 有人用Material Studio进行量化计算吗？有事请教 发信人: phos (:P), 信区: Gaussian

标 题: 有人用Material Studio进行量化计算吗？有事请教 发信站: BBS 大话西游站 (Wed Sep 22 23:53:40 2004), 站内

我最近要用这个软件计算几个含过渡态金属的单点能，有人做过类似工作吗？

本文来源：https://www.bwwdw.com/article/756t.html