Material Studio材料计算的工作站配置方案

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Material Studio材料计算的工作站配置方案

时间:2011-04-23 来源: 网友评论:0 人气: 8450 作者:

本文中的硬件配置已升级到支持inte Xeon E3、E5处理器架构,较原配置性能提升100%以上,更新日期:2013年1月27日 Materials Studio是一套材料科学的仿真软件,MS是在化学和材料领域,为结构和计算器研究者所设计的专业仿真软件,提供用户流畅的操作接口,并包含完整的运算方法,让使用者容易上手并提供功能强大的仿真能力。

研究者通过MS提供的先进丰富多种算法进行综合分析计算,在性质预测、聚合物建模还是X射线衍射模拟,通过一些简单易学的操作来得到切实可靠的数据。协助科学家解决重要问题,研发世界上最先进的材料。

分子模拟(材料计算)求解过程计算特点分析

主要集中在对CPU和内存方面,MS软件支持主流CPU的多核并行计算,在一个架构里,频率越高,核数,计算速度越快,内存方面主要体现在计算的规模上,随着对自然世界的深入了解和分析,分析精度越来越高,计算量也越来越大,对内存的要求也在不断递增,由于求解运算过程中大量时间都在计算中,对显卡的要求自然不高,图卡主要是后期对数据的可视化有些需求,另外MS软件运算特点是将数据一次性放到内存进行密集计算,自然对硬盘外设的读写不是很频繁,传统上SATA接口也足够了,如果内存不够,虚拟内存很大的话,推荐SAS硬盘,当然将来SSD便宜下来,内存和虚拟内存的比例1:2,可以考虑

采用SSD硬盘

硬件配置关系注意事情:

1.经过厂家推荐,目前12核不建议使用,8核Xeon架构效率更高 2.CPU—内存关系, 1核---对应配置---2G~4G, 8核处理器对应内存16GB~32GB. 3.显卡要求不高,针对不同的计算规模,配置相应档次图卡,满足后期数据可视化需求。 4.硬盘IO在计算过程中,影响不大,资金充足的话,视多种计算软件, SAS 6Gbps是目前相当不错的选择

XASUN图形工作站配置方案

XASUN当今世界唯一能提供塔式、机架、便携式、特种结构等规格,提供单路、双路、四路、八路最先进架构的高端图形工作站,XASUN紧随世界领先的intel和AMD的计算处理硬件主流技术,和Nvidia和ATI高性能图卡以及一流的硬盘阵列技术,打造出具有超级性能的XASUN图形工作站和服务器,同时充分了解不同行业应用软件的计算特点,灵活方便的配置架构,使应用软件在任何一台支持基于Windows、Linux等主流操作系统的服务器或工作站上最高效率的进行运算,从而最大限度的发挥工作站硬件性能和网络资源。

MS软件配备丰富的应用功能模块,硬件如何配合好所有软件模块,非一般经验的硬件工程师所能了解的,今天我们对计算规模按原子数量初步划分,大致分三个档次:

1.小规模计算工作站配置方案

定位:原子数不超过100个求解规模 推荐:4核Xeon E3 1270v2(3.5Ghz)/16GB/Quadro600/12GB SSD+1TB SATA

机器型号 XASUN T320 13516-S11T1AA 主要配置 4核XeonE3 1270v2/16GB/Q600/120GB SSD+1TB SATA企业级 硬件配置明细 配件 CPU 芯片组 内存 显卡 系统盘 数据盘 网卡 工作站平台 显示器 噪音控制系统 硬件性能指标 品牌和型号 4核Xeon E3 1270v2 3.5G/hz8MB/超线程/睿频,共计4核 数量 1 1 2 1 1 1 2 1 1 intel C216+PCH Chips 8G DDR3 1600 Reg ECC Nvidia Quadro 600 1GB 120GB SSD 1TB SATA企业级 千兆以太端口 XASUN SSIEC105P7S (700W EPS) 可选 静音级(全速计算45分贝以内) CPU GPU 硬盘 网络端口 硬件升级能力 运算速度每秒1120亿次 几何三角形处理:2.1亿/秒,支持1*2 单屏幕,最高分辨率 2560*1600 几何三角形3亿/秒,像素填充率380亿/秒 支持32X全景反锯齿(FSAA) 支持30位色彩精度 1GB GDDR3显存 IO读写带宽100MB/S,IOPS 200次/秒 通过汇聚功能,实现2Gbps CPU 支持1颗XeonE3 1200v2全系列 显卡 支持Nvidai Quadro和ATI Firepro 系列 内存槽 4个,单根内存最大8GB,最大容量32GB 硬盘位 4个,单块最大SATA:2TB PCI扩展 2*PCIE3.0 x8,2*PCIE3 x4,1*PCI 操作系统 支持Windows Server 2003、2008 支持Windows XP、Vista、7 支持Redhat、Suse Linux全系列 应用软件 基于windows、linux环境下软件全系列 报价 ¥19,800元

2.中大规模计算高端图形工作站配置方案

应用定位:原子数100~1000个之间求解规模

推荐:8核Xeon E5 2643(3.3G)/48GB/quadro2000/240GBSSD+2TB SATA企业级

如果从软件和硬件的价格对比,买一台配置最高的图形工作站,是最好的发挥软件性能的不二选择。

机器型号 XASUN T560 23348-S12T1BB 参考配置: 硬件配置明细 配件 品牌和型号 CPU 4核Xeon E5 2643 3.3Ghz/10MB/6.4GTs/睿频,共计8核 数量 2 1 6 1 1 芯片组 内存 显卡 系统盘 intel C600+PCH Chips 8G DDR3 1333 Reg ECC Nvidia Quadro 2000 1GB 240GB SSD+2TB SATA企业级 光驱 网卡 工作站平台 显示器 噪音控制系统 硬件性能指标 CPU GPU 硬盘 网络端口 DVD刻录机 千兆以太端口 XASUN S600C105PAS (1000W EPS) 可选 静音级(全速计算45分贝以内) 运算速度每秒2112亿次 几何三角形处理:4.1亿/秒, 1 2 1 最高分辨率 2560*1600 192个流处理器, 1GB缓存,64X反锯齿 IO读写带宽100MB/S,IOPS 200次/秒 通过汇聚功能,实现2Gbps 硬件升级能力 CPU 支持2颗Xeon E5 2600全系列 显卡 支持Quadro 全系列,支持双Quadro Plex 内存槽 16个,单根内存最大32GB,最大容量512GB 硬盘位 4个,单块最大SAS:1TB、SATA:2TB PCI扩展 2*PCIE 3.0 x16,2*PCIE 3.0 x8 操作系统 支持Windows Server 2003、2008 支持Windows XP、Vista、7 支持Redhat、Suse Linux全系列 应用软件 基于windows、linux环境下软件全系列 报价 ¥46,500元

3.超大规模计算分布式集群服务器解决方案 定位: 原子数1000个以上求解规模

下面的方案主要是基于办公环境的计算应用,Xeon架构的计算机单机性能越来越强大,最新Xeon5600和单核时代的Xeon相比,快15倍以上,所以基于办公环境的小集群(40核以内),放在办公环境,计算性能满足大部分应用,同

本文来源:https://www.bwwdw.com/article/490v.html

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