第三章课用蛋白质结构与功能的关系
更新时间:2023-06-05 20:17:01 阅读量: 实用文档 文档下载
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第三章蛋白质结构与功能的关系The Relation of Structure and Function of Protein
一、蛋白质一级结构是高级结构与功能的基础(一)一级结构是空间构象的基础
二 硫 键
牛核糖核酸酶 的一级结构 20世纪60年代初,美国科学家C.Anfinsen进行牛胰核糖核酸酶 的变性和复性实验,提出了蛋白质一级结构决定空间结构的 命题。 核糖核酸酶由124个氨基酸残基组成,有4对二硫键。用尿素 和β-巯基乙醇处理该酶溶液,分别破坏次级键和二硫键,肽 链完全伸展,变性的酶失去催化活性;当用透析方法去除变 性剂后,酶活性几乎完全恢复,理化性质也与天然的酶一样。
核糖核酸酶RNase的变性与复性
1960年牛胰核糖核酸酶可逆变性实验:核糖核酸酶在尿素和巯基乙醇处理下 成无规卷曲,活性丧失;透析去除尿素或巯基乙醇后核糖核酸酶活力恢复, 8个巯基氧化重新形成4个二硫键准确无误。
去除尿素、 β-巯基乙醇
天然状态, 有催化活 性
尿素、 β-巯基乙醇
非折叠状态,无活性 概率计算表明,8个半胱氨酸残基结合成4对二硫键,可随机组合成105种 配对方式,而事实上只形成了天然酶的构象,这说明一级结构未破坏,保 持了氨基酸的排列顺序就可能回复到原来的三级结构,功能依然存在。
(二)种属差异 大量实验结果证明,一级结构相似的多肽或蛋白质,其空间结构和 功能也相似,不同种属的同源蛋白质有同源序列,反映其共同进化 起源,通过比较可以揭示进化关系。 例如哺乳动物的胰岛素,其一级结构仅个别氨基酸差异(A链5、6、 10位,B链30位),它们对生物活性调节糖代谢的生理功能不起决 定作用。 胰岛素 人 猪 狗 兔
氨基酸残基序号A5 Thr Thr Thr Thr A6 Ser Ser Ser Gly A10 Ile Ile Ile Ile B30 Thr Ala Ala Ser
牛 羊马
Ala AlaThr
Gly SerSer
Val ValIle
Ala AlaAla
(三)氨基酸序列提供重要的生物化学信息
分子进化
细胞色素c 是由104个氨基酸组成 的蛋白质。比较 50 种不同的生物, 发现由35个是保守的。 如人与黑猩猩的 CytC 相比,种类、 排列顺序和三级结构大体上都相同; 但人与马相比 12 处不同,与小蝇相 比 25 处不同,相差最大的是人与酵 母相比有44处不同。 根据它们在结构上差异程度,可以断 定它们在亲缘关系上的远近,从而为生 物进化的研究提供有价值的依据。
(四)重要蛋白质的氨基酸序列改变可引起疾病-分子病 分子病是指机体 DNA 分子上基因缺陷引起 mRNA 分子异常和蛋白质生物合成的异常,进而导致机 体某些功能和结构随之变异的遗传病。 在 1904 年,发现镰刀状红细胞贫血病。大约化费 了40多年才清楚患
病原因,患者的血红蛋白(HbS) 与正常人的(HbA)相比,仅β-链的第6位上,Val 取代了正常的Glu。目前全世界已发现有异常血红 蛋白400种以上。
氨基酸组成变化改变其功能S S
牛催产素
Cys Tyr Ile Gln Asn Cys Pro Leu Gly
S 牛加压素
S
Cys Tyr Phe Gln Asn Cys Pro Arg Gly
一级结构改变引起分子病 基因突变导致蛋白质一级结构的突变,导致蛋白质生物功能的下
降或丧失,就会产生疾病,这种病称为分子病(molecular disease)。
最早从分子水平证明的先天性遗传病—— 镰刀形红细胞贫血症 (sickle-cell anemia)。正常血细胞镰刀形红细胞
hemoglobin 6: GAA(Glu)
-> GTA(Val)
HbA β 肽 链 N-val · his · leu · thr · pro · glu · glu · · · · ·C(146) HbS β 肽链 N-val · his · leu · thr · pro · val · glu · · · · ·C(146)
(五)蛋白质前体的激活与一级结构 蛋白质前体的激活
一些蛋白质或酶在细胞 中首先合成(翻译)的是其 前体,在成为有功能的蛋 白质或酶之前需要激活。 例如胰岛素(insulin )的前
体是胰岛素原(proinsulin),要在切除C肽之后才转变 为活性的胰岛素。 胰岛素原的一级结构
二、蛋白质的功能依赖特定空间结构(一)血红蛋白亚基与肌红蛋白的构象相似 肌红蛋白/血红蛋白
含有血红素辅基蛋白质的空间结构是 其生物活性的基础, 空间结构变化,其功 能也随之改变。
血红素结构
肌红蛋白(myoglobin,Mb)
肌红蛋白是一个只有三级 结构的单链蛋白质,有8段α-螺 旋结构。 血红素分子中的两个丙酸 侧链以离子键形式与肽链中的 两个碱性氨基酸侧链上的正电 荷相连,加之肽链中的 F8 组氨 酸残基还与 Fe2+ 形成配位结合, 所以血红素辅基与蛋白质部分 稳定结合。
血红蛋白(hemoglobin,Hb)
血红蛋白具有4个亚 基组成的四级结构,每 个亚基可结合 1个血红素 并携带1分子氧。 Hb 亚 基 之 间 通 过 8 对盐键,使4个亚基紧密 结合而形成亲水的球状 蛋白。
蛋白质结构与功能的关系 一级结构决定构象,空间构象决定功能 相似的结构具有相似的功能 结构改变可导致功能改变或丧失 , 亚基与Mb的三级结构相似,结合O2。
不同来源的Hb其三,四级结构相似,运输O2 Hb:四亚基,运输O2
Mb:单亚基,储存O2
Mb 与 Hb 的氧合曲线不同, Mb 为一条双曲 线,Hb是一条 S型曲线。在低p(O2)下,肌 红蛋白比血红蛋白对氧亲和性高很多, p(O2) 为 2.8torr(1torr≈133.3Pa)时,肌红蛋白 处于半饱和状态。在高p(O2)下,如在肺部 (大约 100torr )时,两者几乎都被饱和。 其差异形成一个有效的将氧从肺转运到肌 肉的氧转运系统。
(二)血红蛋白亚基构象变化可影
响亚基与氧结合
蛋白质的变构与血红蛋白的输氧功能
变构作用(Allosteric effect )是指效应剂(变构剂)作用 于多亚基的蛋白质或酶的某个亚基后,导致其构象改变, 继而引起其他亚基构象的改变,结果引起蛋白质或酶的生
物活性发生变化。有的结果是变构激活,有的则是变构抑制。 蛋白质空间结构的改变伴随其功能的变化,称为变构效应。
协同效应(cooperativity)
一个寡聚体蛋白质的一个亚基与其配 体结合后,能影响此寡聚体中另一个亚基
与配体结合能力的现象,称为协同效应。如果是促进作用则称为正协同效应(positive cooperativity)
如果是抑制作用则称为负协同效应(negative cooperativity)
Hb未与氧结合时,其亚基处于一种空间结构紧密的构象 (紧张态,T型),与氧的亲和力小;而 R态对氧具有明 显较高的亲和力,氧的结合使R态更稳定。 在血红蛋白中,其4个亚基与氧分子的亲和性不同。氧分 子与血红蛋白的一个亚基结合后,就能使4个亚基间的盐 键断裂,变成松弛的构象(松弛态,R型),引起其构象 发生改变,这种变化在亚基之间传递,从而改变了其他 亚基与氧的结合能力,使它们与氧的结合变得容易。
T型和R型的相互转换对调节Hb运氧的功能有重要作用。 一个亚基与其配体结合后能促进另一亚基与配体的结合 是正协同效应,其理论解释是 Hb是别构蛋白,有别构效 应。
氧合可以引发维系血红蛋白4个亚基的8对离子键相继断开,从比较 紧凑的T构象转变为比较松弛的R构象。
血红蛋白和肌红蛋白的氧合曲线
与肌红蛋白相比,血红蛋白的多个亚基之间的相互作用使其与 氧的结合能力总体上削弱了(氧合曲线右移,由双曲线转变成S形曲 线),但是赋予了其新的能力—— 可以容易地将其结合的氧从氧分 压高的组织(肺泡)向氧分压低的组织(肌肉)输送和转移。
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