实验方法

更新时间:2023-12-09 13:38:01 阅读量: 教育文库 文档下载

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Western blot 实验

1、试剂配制: (一)母液

1.0mol/L Tris·HCl

Tris (MW121.14) 12.12g 蒸馏水 50ml

溶解后,用浓盐酸调pH至6.8(见下所示),最后用蒸馏水定容至100ml,室温下保存。 注:PH : 6.8 约需22ml浓盐酸

10% SDS

SDS 10g

蒸馏水定容至 100ml

50℃水浴下溶解,室温保存。如在长期保存中出现沉淀,水浴溶化后,仍可使用。

10%过硫酸胺(AP) 过硫酸胺 0.1g 超纯水 1.0ml

溶解后,4℃保存,保存时间为1周,最好现配先用。

1.5mol/L Tris·HCl(pH8.8) Tris 18.2g

蒸馏水 50ml

溶解后,用浓盐酸调pH至8.8,最后用蒸馏水定容至100ml,室温下保存。

30%Acr/Bic(29:1) 丙稀酰胺(Acr) 29g 甲叉双丙稀酰胺Bic 1g 蒸馏水至 100ml

37℃下溶解后,4℃保存。使用时恢复至室温且无沉淀。

20%Tween20

Tween20 20ml 蒸馏水至 100ml 混匀后4℃保存。

10*TBS NaCl 80g KCl 2g Tris 30g

蒸馏水定容至1000ml,溶解后,4℃保存。

TBST

20%Tween20 5ml

10*TBS 100ml

混匀后即可使用,最好现用现配。

TBST缓冲液(含0.05%Tween20的TBS缓冲液) 20%Tween20 1.65ml 1*TBS 700ml

混匀后即可使用,最好现用现配。

电泳液缓冲液(25mmol/L Tris,0.25mol/L甘氨酸,0.1% SDS) Tris 3.03g

甘氨酸 18.77g SDS 1g

蒸馏水至 1000ml

溶解后室温保存,每次溶液可重复使用3~5次。

转膜缓冲液(48mmol/L Tris,39mmol/L甘氨酸,0.037% SDS,20%甲醇) 甘氨酸 14.4g Tris 3g

甲醇 200ml 蒸馏水至 1000ml

溶解后室温保存,次溶液可重复使用3~5次。

10%分离胶和4%浓缩校

10%分离胶(两块胶,10ml) 蒸馏水 4.0ml

30%Acr/Bic 3.3ml 1.5mol/L Tris 2.5ml 10%SDS 100μl 10% AP 100μl TEMED 5μl

4%浓缩胶(两块胶,5ml) 蒸馏水 3.4ml

30%Acr/Bic 830μl 1.0mol/L Tris 630μl 10%SDS 50μl 10% AP 50μl TEMED 5μl

封闭液(含5%脱脂奶粉的TBST缓冲液)

脱脂奶粉 5g TBST 100ml

溶解后4℃保存。使用时,恢复室温,用量以盖过膜面即可,一次性使用。 BSA 0.3g TBST 20ml

溶解后4℃保存。使用时,恢复室温,用量以盖过膜面即可,一次性使用。

贴壁细胞总蛋白的提取:

1、倒掉培养液,并将瓶倒扣在吸水纸上使吸水纸吸干培养液(或将瓶直立放置一 会儿使残余培养液流到瓶底然后再用移液器将其吸走)。

2、每瓶细胞加1ml 4℃预冷的PBS。平放轻轻摇动1min洗涤细胞,然后弃去洗液。重复以上操作两次,共洗细胞三次以洗去培养液。将PBS弃净后把培养瓶置于冰上。 3、按100ml RIPA加1μlPMSF,摇匀置于冰上。(PMSF要摇匀至无结晶时才可与裂解液混合。)

4、每孔细胞加200μl含PMSF的裂解液,于冰上裂解30min,为使细胞充分裂解 培养瓶要经常来回摇动。

5、裂解完后,用干净的刮棒将细胞刮于培养瓶的一侧(动作要快),然后用枪将细胞碎片和裂解液移至1.5ml离心管中。(整个操作尽量在冰上进行。) 6、于4℃下12000rpm离心5min。(提前开离心机预冷) 7、将离心后的上清分装转移倒EP管中放于-20℃保存。 煮蛋白:

1、取100ul上清,加入25ul的5*SDS-PAGE上样缓冲液混匀。 2、95℃ 5min,45℃,放4℃保存。 SDS-PAGE电泳:

一、清洗玻璃板:一只手扣紧玻璃板,另一只手蘸点洗衣粉轻轻擦洗。两面都擦洗过后用自来水冲,再用蒸馏水冲洗干净后立在烘箱晾干。 二、灌胶与上样 1、玻璃板对齐后放入夹子中卡紧。然后垂直卡在架子上准备灌胶。(操作时要使两玻璃对齐,以免漏胶。)

2、按前面方法配10%分离胶,加入TEMED后立即摇匀即可灌胶。灌胶时,可用1ml枪吸取1ml胶沿玻璃放出,待胶面升到绿带中间线高度时即可。然后胶上加一层水,液封后的胶凝的更快。(灌胶时开始可快一些,胶面快到所需高度时要放慢速度。操作时胶一定要沿玻璃板流下,这样胶中才不会有气泡。加水液封时要很慢,否则胶会被冲变型。)

3、当水和胶之间有一条折射线时,说明胶已凝了。再等3min使胶充分凝固就可倒去胶上层水并用吸水纸将水吸干。

4、按前面方法配5%的浓缩胶,加入TEMED后立即摇匀即可灌胶。将剩余空间灌满浓缩胶然后将梳子插入浓缩胶中。灌胶时也要使胶沿玻璃板流下以免胶中有气泡产生。插梳子时要使梳子保持水平。由于胶凝固时体积会收缩减小,从而使加样孔的上样体积减小,所以在浓缩胶凝固的过程中要经常在两边补胶。待到浓缩胶凝固后,两手分别捏住梳子的两边竖直向上轻轻将其拔出。

5、用水冲洗一下浓缩胶,将其放入电泳槽中。(小玻璃板面向内,大玻璃板面向外。若只跑一块胶,那槽另一边要垫一块塑料板且有字的一面面向外。)

6、加足够的电泳液后开始准备上样。3ul marker ,7.5ul蛋白(电泳液至少要漫过内测的小玻璃板。)用微量移液器贴壁吸取样品,将样品吸出不要吸进气泡。将加样器针头插至加样孔中缓慢加入样品。(加样太快可使样品冲出加样孔,若有气泡也可能使样品溢出。加入下一个样品时,移液器需在外槽电泳缓冲液中洗涤3次,以免交叉污染。 三、电泳

上层胶电泳:80V,20min;待样品跑至下层胶,且每孔样品在同一水平时,电泳调整至:110V,90 min。带条带跑至玻璃板最下方即可终止电泳,进行转膜。 四、转膜 (1)、转一张膜需准备4张7.0~8.3cm的滤纸和1张7.3~8.6cm的PVDF膜。切 滤纸和膜时一定要戴手套,因为手上的蛋白会污染膜。将切好的PVDF膜,在甲醇中浸泡3s,置于双蒸水中浸泡后才可使用。(用镊子捏住膜的一边轻轻置于有超纯水的平皿里,要使膜浮于水上,只有下层才与水接触。这样由于毛细管作用可使整个膜浸湿。若膜沉入水里,膜与水之间形成一层空气膜,这样会阻止膜吸水)。 (2)、在加有转膜液的盘里放入转膜用的夹子、两块海绵垫、一支玻棒、滤纸和 浸过的膜。 (3)、将夹子打开使黑的一面保持水平。在上面垫一张海绵垫,用玻棒来回擀几遍以 擀走里面的气泡。(一手擀另一手要压住垫子使其不能随便移动。)在垫子上垫2层滤纸(可2张纸先叠在一起在垫于垫子上),一手固定滤纸一手用玻棒擀去其中的气泡。 (4)、要先将玻璃板撬掉才可剥胶,撬的时候动作要轻,要在两个边上轻轻的反复撬。 撬一会儿玻璃板便开始松动,直到撬去玻板。(撬时一定要小心,玻板很易裂。)除去小玻璃板后,将浓缩胶轻轻刮去(浓缩胶影响操作),要避免把分离胶刮破。小心剥下分离胶盖于滤纸上,用手调整使其与滤纸对齐,轻轻用玻棒擀去气泡。将膜盖于胶上,要盖满整个胶(膜盖下后不可再移动)并除气泡。在膜上盖3张滤纸并除去气泡。最后盖上另一个海绵垫,擀几下就可合起夹子。整个操作在转移液中进行,要不断的擀去气泡。膜两边的滤纸不能相互接触,接触后会发生短路。(转移液含甲醇,操作时要戴手套,实验室要开门以使空气流通。) (5)、将夹子放入转移槽槽中,要使夹的黑面对槽的黑面,夹的白面对槽的红面。电 转移时会产热,在槽的一边放一块冰来降温。一般用100V转移2h。 (6)、转完后将膜用1×TBST清洗3遍,15分/次。 五、封闭 封闭液: BSA 0.3g TBST 20ml

将封闭用的盒子用双蒸水清洗干净后置干,倒入配好的封闭液,将贴着胶的那面膜视为正面,将膜放入封闭液时,正面朝上,反面朝下,室温振荡2h,结束后用TBST清洗,15分/次,共3次。

六、孵育抗体:

1、将一抗按说明书比例稀释:1:1000(TBST),倒入敷育盒中,将膜正面朝上放入孵育液中,室温振荡2h后,置于4度冰箱过夜,至少8小时。

2、回收一抗,可重复利用,后用TBST清洗三次,15min/次。 3、将二抗按比例稀释后倒入敷育盒,室温振荡2h。 七、曝光: 配置曝光液

每张膜曝光30张左右。

测序: 一、取血

二、全血基因组DNA提取:

本试剂盒分 Part I 和 Part II 两部分 ■ Part I 部分(-20℃保存) Proteinase K(20 mg/ml) 1 ml RNase A(10 mg/ml) 500 μl

■ Part II 部分(室温 15~25℃保存) 10×Buffer RCL A*1 10×Buffer RCL B*2 Buffer GB*3 Buffer WA*3 Buffer WB*4 Elution Buffer

Spin Columns 50 支 Collection tubes 50 支

*1 和*2 使用前按照 1:4 的比例混合,得到 10×Buffer RCL(红细胞裂解液)。该 10×Buffer RCL可以现用现配或在首次使用时将*1 全部倒在*2 的试剂瓶中,于 4℃可保存 1 年。 *3 含有强变性剂,应避免与皮肤、衣物等接触。若不小心接触到眼睛或皮肤时,请立即到医院进行处理。

*4 在首次使用前,请添加 56 ml 的 100%乙醇,混合均匀。 【试剂盒之外所需准备试剂】 ◆ 无水乙醇 ◆ 灭菌蒸馏水 ◆ PBS Buffer ● 保存与运输

1. 本试剂盒分两部分保存和运输,Part I 请在-20℃保存和运输;Part II 在室温下(15-25℃)保存和运输。

2. 10×Buffer RCL A,10×Buffer RCL B 可于室温下保存,按比例混合后的 10×Buffer RCL 可于 4℃保存 1 年,客户可根据实际使用情况决定保存方式。 ● 实验前的准备 1. 准备 56℃水浴。

2. 将 10×Buffer RCL A 和 10×Buffer RCL B 按照 1:4 的比例混合,得到 10×Buffer RCL。在使用前用灭菌蒸馏水将 10×Buffer RCL 稀释 10 倍后使用,按照要处理全血 2 倍体积量准备 1×Buffer RCL,并且要现配现用,请勿将稀释液长时间保存,以免影响裂解效果。 3. Buffer WB 在首次使用前,请添加 56 ml 的 100%乙醇,混合均匀。

4. 洗脱结合于 DNA 制备膜上的基因组 DNA 时,将 Elution Buffer 或灭菌蒸馏水加热至 65℃使用将会提高基因组 DNA 的洗脱效率。 提取无核红细胞血液材料时:

◆ 200 μl~1 ml 新鲜全血起始:按照操作步骤 1~15 进行;

◆ 200 μl~1 ml 冻存全血起始:2,000 rpm 离心 5 分钟,弃多余上清(使用移液器小心吸取),保留 200 μl 上清及沉淀物,处理好的样品直接按操作步骤 7~15 继续操作; ◆ 全血体积不足 200 μl 时,用 PBS 将全血总体积补至 200 μl后直接按操作步骤 7~15 继续操作。

本文来源:https://www.bwwdw.com/article/00c5.html

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